ADN-Y: HAPLOGRUPO A

A partir de los estudios de Fulvio Cruciani(2011) se ha revisado la antigüedad y la estructura genética de este haplogrupo. De monofilético pasó a ser parafilético, y su antigüedad se elevó a 300.000 años. Karafet propuso una nueva estructura del grupo en 2008. La última revisión data de 2014.
Se trata del haplogrupo descendiente del Adán Cromosómico o “ancestro común más reciente que poseía el cromosoma Y” (ACMR-Y), un linaje surgido de un varón (o un grupo de ellos) que habría vivido en África Centro-Noroccidental. Eso se deduce de los estudios del equipo de Cruciani que, en 2011, encontró los linajes relictos A1a y A1b en poblaciones aisladas de África Occidental, Norte de África y en los pigmeos bakola de Camerún, con una antigüedad de 142.000 años.  Sin embargo más recientemente se ha localizado un linaje aún más antiguo en una familia afroamericana de Carolina del Sur (EEUU): con 338.000 años sería más antiguo que cualquier fósil de humano moderno encontrado hasta ahora, por lo que sería atribuible a un Homo “arcaico” (heildelbergensis o rhodesiensis). Este cromosoma original ha sido rastreado hasta una pequeña población del oeste de Camerún: los mbo.

El Haplogrupo A es típico de los pueblos Khoisan y Nilótico: sus mayores frecuencias se encuentran en África Austral, Sudán del Sur y Etiopía. Las frecuencias más altas aparecen en los san tsumkwe de Namibia (66%), los nama (64)%), los dinka de Sudán del Sur (62%), los shilluk (53%), los nuba (46%) y en los falasha de Etiopía (41%). La frecuencia promedio en los san es de 12-48%. En los iraqw de Tanzania es de 17%. En los bantúes de Kenia llega al 14%. En los mandara de Camerún también es de 14%. En los fulbe de Camerún es de 12%. Llega a 14,6% en amhara etíopes y 10% en oromos. Se han registrado pequeñas frecuencias en Gabón y en pigmeos baka, bakola y mbuti.Los subclados según orden de derivación sería el siguiente: A00, A0, A1 (A1’2’3’4), A1a (A1), A1b (A2’3), A1b1a (A2), A1b1b (A3), BT (A4).

Surgido hace 70.000 años el Haplogrupo A es en realidad un conjunto de linajes no necesariamente relacionados, que se definen por la ausencia de los marcadores del Haplogrupo B-T. La mutación del marcador M91, que afecta un tramo de 8 unidades nucleobásicas de 9T (Timina), separó a B-T de A1b1 hace entre 80-70.000 años. A pesar de ser considerado un Haplogrupo, las divergencias genéticas dentro del mismo llegan a ser aún más profundas que las que lo separan de B-T. Es el caso de los subclados A1 o A1'2'3'4 (antes A1a-T) y A1b (en especial M-13 (A1b1b2b), típicos del área nilótica, que difieren notoriamente de los subclados presentes entre los khoisán, evidenciando una antigua divergencia hace 150.000 años aproximadamente entre los linajes sudafricanos y los de África Oriental y Camerún.Los subclados más antiguos se encuentran exclusivamente en África centro-noroccidental, donde presuntamente se originó el Haplogrupo. Fue desplazado desde hace 5.000 años producto de la expansión bantú que introdujo el clado E1b1a actualmente predominante. Las frecuencias más altas del Haplogrupo A aparecen en los Khoisan, Nilo-saharianos y Beta-Israelíes.

A00 L1086  (L1159) (AF6/L1284, AF4, AF5, AF7, AF8, AF9, AF10, AF13, L1086, L1087, L1088, L1091, L1092, L1094, L1096, L1097, L1102, L1103, L1104, L1106, L1107, L1108, L1109, L1110, L1111, L1113, L1114, L1115, L1117, L1119, L1122, L1126, L1131, L1133, L1134, L1138, L1139, L1140, L1141, L1144, L1146, L1147, L1148, L1151, L1152, L1154, L1156, L1157, L1158, L1159, L1160, L1161, L1163, L1233, L1234, L1236) Encontrado en muy pequeñas frecuencias en Carolina del Sur (EEUU) en 2012 (en un hombre llamado Albert Perry) y en once varones mbo de Camerún (en una muestra de 174 individuos). Un estudio de 2015 reveló que la mayor concentración se encuentra en los Bangwa/Nweh (27 de 67 muestras positivas, 40,3%). Mientras que entre los Nkongho Mbo se lo encontró en 8 de 86 muestras (9,3%).
 A0'1'2'3'4-L1085*(xV148,V168) (L1130  L1155) A0-T   L1085, AF3, L1089, L1090, L1093, L1095, L1098, L1099, L1101, L1105, L1116, L1118, L1120, L1121, L1123, L1124, L1125, L1127, L1128, L1129, L1130, L1132, L1135, L1136, L1137, L1142, L1143, L1145, L1150, L1155, L1235
   A0-V148*(xL979,L1036) V148=rs181335666  (V166=rs187287389  L896) (A0   CTS2809/L991, L529.2, L896, L982, L984, L990, L993, L995, L997, L998, L999, L1000, L1001, L1006, L1008, L1010, L1012, L1016, L1018, L1055, V148, V149, V154, V165, V166, V172, V173, V176, V177, V190, V196, V223, V225, V229, V233, V239) Encontrado en bajas frecuencias en bakola del sur de Camerún (8,3%), bereberes argelinos (1,5%), en Ghana y en Jamaica.
      A0a L979  (L980  L987) A0-L979*(xV164,L994) (L979, L980, L987, L996, L1011, L1015, L1017)
             A0a1  A0-V164 V164=rs181016083  (L1075) (L1070, L1072, L1073, L1075, L1076, L1078, L1079, L1080, L1081, L1082, V150, V153, V157, V158, V159, V162, V164, V170)
                   A0a1a   P114, V151, V152, V161.1, V169, V181, V195
                   A0a1b   L1289
              A0a2 A0-L994 L994=rs371502065  (L981) (L981, L983, L988, L994, L1007, L1014, V203)
      A0b A0-L1036 L1036  (L1058) (L92.2, L1035, L1036, L1037, L1038, L1039, L1040, L1041, L1042, L1043, L1044, L1045, L1046, L1047, L1048, L1049, L1050, L1051, L1052, L1054, L1056, L1057, L1058)
   A1'2'3'4  A1'2'3'4-V168*(xM31,P108) V168=rs191505182  (V171=rs2524861  P305=rs72625368) (A1   L985, L986, L1002, L1003, L1004, L1005, L1084, L1112, L1153, P305, V161.2, V168, V171, V174, V238, V241, V250) Surgido hace 105.000 años en África Occidental.      A1a (A1) A1-M31 M31=rs369315948  (P82  V4=rs187409543) (A1a M31, P82, V4, V14, V15, V25, V26, V28, V30, V40, V48, V57, V58, V63, V191, V201, V204, V215) Presente en bajas frecuencias (0,5% en Cabo Verde a 7,8% en Mankanya de Guinea-Bissau) en África Occidental (Gambia, Cabo Verde, Senegal, Guinea-Bissau, Mali, Níger y Marruecos). También se lo encontró en 2007 en siete hombres en Yorkshire (Inglaterra), todos ellos parte de la familia Revis, a los que se encontró un antepasado por línea masculina  en el siglo XVIII.
      A1b (A2'3'4) A2'3'4-P108*(xL419,M42) P108 (V221=rs188292317)(A1b P108, FGC8027, L989, L1009, L1013, L1053, M11301/Z11908, V221, Z11891, Z11892, Z11893, Z11894, Z11895, Z11896, Z11897, Z11898, Z11899, Z11900, Z11901, Z11902, Z11903, Z11904, Z11905, Z11906, Z11907, Z11909, Z11910, Z11911, Z11912, Z11913, Z11914, Z11915, Z11916, Z11917, Z11918, Z11919, Z17890, Z17891, Z17892, Z17893, Z17894, Z17895, Z17896, Z17897, Z17898, Z17899, Z17900)
             A1b1 (A2'3) A2'3-L419*(xV50,M32) L419=rs111762602  (PK1=rs373116908) (A1b1   L419/PF712)                   A1b1a (A2) A2-V50*(xP3) V50=rs189205028  (L602) (A1b1a   L602, V50, V82, V198, V224)       
                            A1b1a1 (P3)  A2-P3*(xM6) P3  (M14=rs3905) (M14, M23, L968/M29/P3/PN3, M71, M135, M141, M206, M276/P247, M277/P248, MEH1, P4, P5, P36.1, Page71, Page87, Page95)                                 A1b1a1a (M6) A2-M6*(xP28,L963) M6=rs3897 (M6, M49/Page41, M196) Presente en África Austral, sobre todo en khoisan. Tsumkwe San (28%), Kung/Sekele (16%).                                              A1b1a1a1 (P28) A2-P28 P28=rs374971653 . Tsumkwe San (17%), Kung/Sekele (9%), Nama ()%), Dama (6%).                                              A1b1a1a2 (L963) A2-L963
                                                           A1b1a1a2a   M114, M212
                                                           A1b1a1a2b   P262
                   A1b1b (A3)   M32 A3-M32*(xM28,M144) África Oriental y Sur de África.
                            A1b1b1 (M28) A3-M28 (M28=rs369313031) Encontrado en Etiopía y Somalía. 5% en pueblos semítico-hablantes, 1,1% en etíopes y 0,5% en somalíes.
                            A1b1b2 (M144) A3-M144*(xM51,M13) M144=rs2032619  (M190=rs2032603  P289=rs372246020) (L427, L430, M144, M190/Page35/PF1373, M220, M305/Page17, P289/PF1372, Page50, PF1365/V160)
                                 A1b1b2a (M51) A3-M51 (M51=rs34078768) (M51/Page42, M229, M239/Page89, P71, P100) Aparece en khoisan, sobre todo en los nama (55%). 28% en muestras genéricas de Khoisan, 21% en Tsumkwe San, 6% en Dama. También se da en bantúes sudafricanos: 7% en Sotho-Tswana, 6% en bantúes sudafricanos genéricos, 5% en Xhosa y 3% en Zulú.
                                              A1b1b2a1 P291
                                                        A1b1b2a1a P102
                                 A1b1b2b (M13) A3-M13*(xM118) M13=rs3904  (M202=rs2032649  V10=rs34555473) M13/PF1374, M63/PF1079, M127, M202, M219, Page53, Page77/PF1364/V10 Importantes frecuencias en Sudán del Sur, Cuerno de África y África Oriental  (es el principal haplogrupo de los nilóticos). Entre los dinka (61,5%), sudaneses del sur (52,8%), nuba (46,4%), sudaneses occidentales (27,8%), hausa (12,5%), sudaneses del norte (2,3%). En Beta Israel (41%), en amhara (14,6%), oromo (10,3%), etíopes genéricos (5,7%). En los bantúes de Kenya (14%) e Iraqw de Tanzania (7 a 17%). Aparece en pequeñas frecuencias en norte de Camerún: tupuri (22%), mandara (14%), fulbe (12%). También en República Democrática del Congo: alur (22%), hema (6%) y mbuti (2%). Fuera de África aparece en pequeñas concentraciones en: Región Egea de Turquía y en Mitilene, capital de Lesbos en Grecia (6,7%), judíos yemeníes (5%), sardos (4,5%), chipriotas (3,1%), egipcios genéricos (2,7%), árabes palestinos (1,4%), jordanos de Ammán (1%) y omaníes (0,8%). También hay muestras pequeñas en sur y centro de Portugal e islas Madeira.
                                              A1b1b2b1  M118 A3-M118  Etíopes genéricos (6,8%) 
             A4=BCDEF (BT) A4-M42*(xM60,M168) M42=rs2032630  (SRY10831#=rs2534636  P97) (M91, CTS5903/M9174/PF795/S1572, CTS7503/M9219, L413/PF1409/V31, L418, L438, L440, L604/PF1243, L962, L969, L1060/PF1021, L1061/PF1101, L1062/PF302, L1071/M8945, L1220/M9212, M42, M94/PF1081, M139, M251/M9122/PF699, M299, M8947, M8949, M8951, M8952, M8953/PF1405/V216, M8954, M8955/PF12, M8956, M8957, M8958/PF196, M8959, M8961/PF201, M8967, M8968/PF207, M8969/PF1407/V21, M8970/PF208, M8971, M8972, M8973, M8976/PF215, M8977, M8979/PF226, M8980/PF229, M8983/PF230, M8985/PF232, M8986, M8988, M8993, M8994, M8995, M8997/PF260, M8999, M9000, M9001, M9003, M9004/PF270, M9005, M9006, M9008, M9009, M9010, M9011, M9015, M9016, M9017/PF282, M9019/PF286, M9020/PF287, M9021/PF288, M9025, M9026, M9027, M9028/PF298, M9030, M9031, M9032/PF304, M9034, M9036/PF308, M9037, M9038/PF313, M9039, M9041/PF319, M9042, M9043, M9045, M9046/PF324, M9054, M9056, M9057, M9064/PF350, M9065/PF351, M9066, M9069/PF635, M9070, M9075, M9076, M9077, M9079, M9080, M9081, M9083, M9086/PF648, M9087, M9089/PF653, M9094/PF671, M9095, M9097/PF672, M9098, M9099/PF674, M9100, M9102, M9103/PF679, M9105, M9109, M9110/PF684, M9111, M9112, M9113, M9114, M9115, M9116/PF688, M9117, M9118/Page81, M9121, M9123, M9124/PF701, M9125, M9126/PF703, M9127, M9128, M9129/PF707, M9130/PF708, M9131, M9133/PF715, M9135, M9136/PF724, M9138, M9139, M9140, M9141, M9142/PF731, M9143/PF732, M9145/PF733, M9146, M9148/PF744, M9151, M9152, M9155/PF762, M9156/PF764, M9157/PF766, M9159/PF767, M9160/Page24, M9162, M9163/PF777, M9165, M9166/PF785, M9169, M9172, M9173/PF794, M9176, M9177, M9178, M9179, M9180, M9182, M9187, M9188, M9189, M9192, M9193, M9194.3/PF825.3, M9195, M9196, M9197, M9198, M9199/PF834, M9200/PF835, M9202, M9203/PF837, M9204, M9209, M9210, M9213, M9214, M9215/PF847, M9216, M9217/PF857, M9218/PF860, M9220, M9221, M9223/PF865, M9225/PF868, M9226/PF869, M9227, M9228, M9230/PF870, M9231/PF876, M9234, M9235/PF886, M9237/PF890, M9238, M9239, M9240/PF896, M9242/PF899, M9244, M9245, M9246, M9248, M9249, M9251/PF913, M9252, M9253/PF914, M9254, M9255/PF925, M9257, M9258, M9260, M9261/PF931, M9262/PF932, M9263, M9265, M9266/PF946, M9267/PF948, M9269, M9271, M9277, M9278/PF969, M9280, M9282, M9283/PF973, M9284, M9285, M9286, M9287, M9288/PF985, M9289/PF988, M9290/PF989, M9291, M9292, M9293/PF997, M9295/PF1000, M9296, M9298/Z12093, M9300, M9301/PF1015, M9302, M9303, M9306, M9310, M9311/PF1030, M9312, M9314, M9315/PF1033, M9316/PF1034, M9317, M9318, M9319, M9321/PF1045, M9322/PF1049, M9323/PF1050, M9325, M9326, M9327, M9328/PF1053, M9331/PF1057, M9334, M9335/PF1060, M9336/Page26, M9338/PF1064, M9340, M9341/PF1072, M9343, M9344, M9346, M9347, M9348/PF1093, M9349, M9352/PF1100, M9353, M9356, M9357/PF1209, M9359, M9360, M9361, M9362, M9365/PF1218, M9366, M9367, M9368, M9369, M9370, M9372, M9373, M9374/Z4690, M9376, M9377/PF1421, M9378, M9379/PF1253, M9380/PF1256, M9382/PF1257, M9387, M9389, M9390/PF1262, M9393, M9394/PF1271, M9396, M9397, M9398/PF1279, M9399/PF1283, M9405, M9406, M9408/PF1296, M9410, M9411/PF1315, M9412, M9417, M9420, M9421, M9425, M11752, M11753/PF243, M11754, M11755/PF280, M11756/PF301, M11757/PF327, M11759, M11760, M11762, M11767, M11773/PF809, M11779/PF1027, M11780/PF1044, M11781, M11787/PF1311, M11789/PF1332, P97, Page65.1/SRY1532.1/SRY10831.1, PF16, PF20, PF28, PF51, PF69, PF72, PF73, PF79, PF122, PF127, PF133, PF135, PF149, PF161, PF162, PF167, PF175, PF177, PF236, PF338, PF420, PF462, PF468, PF509, PF585, PF591, PF592, PF601, PF620, PF622, PF626, PF627, PF632, PF713, PF918, PF1026, PF1042, PF1096, PF1143, PF1178, PF1184, PF1196, PF1201, PF1247, PF1248, PF1249, PF1252, PF1274, PF1318, PF1325, V29/PF1408, V59/PF1411, V64/PF1412, V102/PF1406, V187/PF1403, V202/PF1404, V235/PF1410, Z11924, Z11926, Z11927, Z11929, Z11930, Z11931, Z11932, Z11933, Z11937, Z11938, Z11939, Z11940, Z11941, Z11943, Z11945, Z11948, Z11970, Z11971, Z11978, Z11979, Z11980, Z11981, Z11983, Z11984, Z11985, Z11986, Z11987, Z11988, Z11989, Z11990, Z11991, Z11993, Z11997, Z11999, Z12001, Z12002, Z12003, Z12004, Z12005, Z12006, Z12007, Z12008, Z12031, Z12047, Z12070, Z12071, Z12077, Z12094, Z12095, Z12096, Z12110, Z12111, Z12128, Z12129, Z12138, Z12139, Z17332, Z17333, Z17334, Z17335, Z17336, Z17337, Z17338, Z17339, Z17340, Z17341, Z17342, Z17343, Z17344, Z17345, Z17346, Z17347, Z17348, Z17349, Z17350, Z17351, Z17352, Z17353, Z17354, Z17355, Z17356, Z17357, Z17358, Z17359, Z17360, Z17361, Z17362,
Z17363, Z17364, Z17365, Z17366, Z17367, Z17368, Z17369, Z17370, Z17371, Z17372, Z17373, Z17374, Z17375, Z17376, Z17377, Z17378, Z17379, Z17380, Z17381, Z17382, Z17383, Z17384, Z17385, Z17386, Z17387, Z17388, Z17389, Z17390) Z40372, Z40373, Z40374, Z40375, Z40376, Z40377, Z40378, Z40379, Z40380, Z40381, Z40382, Z40383, Z40384, Z40385, Z40386, Z40387, Z40388, Z40389, Z40390, Z40391, Z40392, Z40393, Z40394, Z40395, Z40396, Z40397, Z40398, Z40399, Z40400, Z40401, Z40402, Z40403, Z40404, Z40405, Z40406, Z40407, Z40408, Z40409, Z40410, Z40411, Z40412, Z40413   

Study population Población del estudio	Freq. Freq. (in %) (En%)
Tsumkwe San (Namibia) Tsumkwe San (Namibia)	66% 66%
Nama (Namibia) Nama (Namibia)	64 64
Dinka (Sudan) Dinka (Sudán)	62 62
Shilluk (Sudan) Shilluk (Sudán)	53 53
Nuba (Sudan) Nuba (Sudán)	46 46
Khoisan Khoisan	44 44
Ethiopian Jews Judíos etíopes	41 41
!Kung /Sekele Kung / Sekele	~40 ~ 40
Borgu (Sudan) Borgu (Sudán)	35 35
Nuer (Sudan) Nuer (Sudán)	33 33
Fur (Sudan) Piel (Sudán)	31 31
Maasai (Kenya) Maasai (Kenia)	27 27
Nara (Eritrea) Nara (Eritrea)	20 20
Masalit (Sudan) Masalit (Sudán)	19 19
Amhara (Ethiopia) Amhara (Etiopía)	~16 ~ 16
Ethiopians Etíopes	14 14
Bantu (Kenya) Bantu (Kenia)	14 14
Mandara (Cameroon) Mandara (Camerún)	14 14
Hausa (Sudan) Hausa (Sudán)	13 13
Khwe (South Africa) Khwe ( Sudáfrica )	12 12
Fulbe (Cameroon) Fulbe (Camerún)	12 12
Dama (Namibia) Dama (Namibia)	11 11
Oromo (Ethiopia) Oromo (Etiopía)	10 10
Kunama (Eritrea) Kunama (Eritrea)	10 10
South Semitic (Ethiopia) Semítico del sur (Etiopía)	10 10
Arabs (Egypt) Árabes (Egipto)	3 3

https://en.wikipedia.org/wiki/Haplogroup_A_(Y-DNA) https://en.wikipedia.org/wiki/Haplogroup_A_(Y-DNA)#cite_note-Luis2004-22 Wood ET, Stover DA, Ehret C, et al. (July 2005). "Contrasting patterns of Y chromosome and mtDNA variation in Africa: evidence for sex-biased demographic processes". Eur. J. Hum. Genet.Hassan HY, Underhill PA, Cavalli-Sforza LL, Ibrahim ME (November 2008). "Y-chromosome variation among Sudanese: restricted gene flow, concordance with language, geography, and history" (PDF). Am. J. Phys. Anthropol.
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http://www.wilkinsonsworld.com/wp-content/gallery/ju-hoansi-san/10097-bushmen-near-tsumkwe-23102010.jpg (TSUMKWE)http://www.brafot.nl/Tribal%20Faces%20SV/photos/Nama_4.jpgDinka man with traditional pipe. He has plastered himself with cow dung and ash to ward off mosquitos: http://www.bahr-el-jebel-safaris.com/image/96291659.jpg   Bahr El Jebel Safaris: http://www.bahr-el-jebel-safaris.com/Dinka_Villages.htmlhttp://www.fos.su.se/~arnold/travel/ethiopia2011/falashas/images/fullsize/etiopien2011__1428.JPG.JPG (FALASHA)

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